俄羅斯總統在一場軍事行動遭到囚禁，一名瘋狂的俄羅斯將軍意圖挑起第三次世界大戰，傑瑞德巴特勒飾演的潛水艇船長將與一支美軍海豹突擊隊合作，展開對俄羅斯總統的救援行動。

《潛艦獵殺令》故事描述在北極海的海底深處，美國潛艦艦長喬葛拉斯（傑瑞德巴特勒 飾）受到參謀長聯席會議主席查爾斯唐納根上將（蓋瑞歐德曼 飾）指派，前往搜尋一艘失蹤的美國潛艇，卻意外發現俄國即將發生一場軍事政變，眼看就要瓦解世界的秩序。葛拉斯艦長要保護艦上人員的安危，更要捍衛國土，他必須集結一支海軍精英特種部隊，前往搭救被綁架的俄國總統，並潛入敵軍海域，阻止第三次世界大戰爆發！

電影開拍前，傑瑞德巴特勒與導演便罕見地獲得美國海軍許可，親自前往珍珠港，搭上機密級的核子潛艇，展開整整三天海底生活，讓他大開眼界。傑瑞德巴特勒回想當時情景：「我就像拿到糖果的小孩，一登上潛艇就非常興奮，嘖嘖稱奇、完全停不下來！」此外，美軍更帶著全劇組進入訓練新兵專用的模擬裝置之中，讓他們直接面對艦艇漏水和砲彈室起火等緊急戰鬥狀況。